Un dels objectius prioritaris de la Fundació, a més a més de promoure el debat polític i cultural en base als principis de la laïcitat i el progrés, que inspiren la seva actuació, és reivindicar la memòria històrica col·lectiva de l'esquerra d'aquest país, i en concret de la vida i l'obra de Francesc Ferrer i Guàrdia. Des dels seus inicis, la Fundació ha anat treballant en la constitució de l'Arxiu i biblioteca Ferrer i Guàrdia, mitjançant l'adquisició de llibres i/o la reproducció (fotocòpies, microfilms) de tot tipus de documentació relacionada amb Ferrer i la seva època.

L'Arxiu i Biblioteca va rebre un nou impuls amb la primera donació de llibres i documents procedents de la família Ferrer. Els descendents de Josep Ferrer (germà de Francesc) van donar a la Fundació 102 llibres i varis documents que havien pertangut a Ferrer. L'itinerari que havien seguit aquests llibres simbolitza el curs de la història del nostre país després de 80 anys on la por a les idees avançades ha estat a l'ordre del dia. No és per casualitat que aquests llibres vegin la llum quan vivim l'època més llarga de democràcia. La Fundació vol agrair profundament a la Família Ferrer la seva ajuda en la tasca de dignificar la vida i l'obra d'aquest il·lustre pedagog i llliurepensador català. La donació constitueix la recuperació per a la investigació històrica d'una documentació inèdita, fins ara, i molt interessant.

De la donació destaca:

• 29 llibres de l'editorial de l'Escola Moderna, amb autors com: Condorcet, Odón de Buen, Jean Grave, Clémentine Jacquinet, Letourneau, Enrique Llúria, Carlos Malato, Martínez Vargas, Fabià Palasí, Pi y Arsuaga, Federico Urales, etc.
• El manual "L'espagnol pratique" de Ferrer, editat a París l'any 1897. Conté diverses narracions curtes de Pi y Margall, Àngels López de Ayala (una de les primeres feministes catalanes), etc.
• Els butlletins de l'Escola Moderna de 1901 a 1903, enquadernats i en perfecte estat de conservació.
• Els llibres de les "Causas" de l'atemptat a Alfonso XIII de 1906 i de la revolta de la Setmana Tràgica de 1909.

I els documents manuscrits següents:

• Dues llibretes per a l'estudi d'idiomes (1892-93), una petita llibreta de notes de viatge amb apunts i reflexions de diversos autors.
• L'agenda de Ferrer (1900-01) amb les adreces de tots els seus amics i coneguts -com Kropotkin, Pi y Margall, Lerroux, etc.- d'arreu del món (per exemple, Nova York, Londres, París, Brussel·les, Melbourne, Madrid o València). És molt interessant per reconstruir el món de les relacions d'un home tan complex com Francesc Ferrer i Guàrdia.
• La llibreta de poesies "Pasado, presente, futuro" escrites per Ferrer durant el seu captiveri a la presó Modelo de Madrid (1906). Les dues primeres parts són un cant a l'amor i a la parella lliure i una crítica als prejudicis burgesos i victorians de l'època així com una crítica a la intromissió de l'església i l'Estat en la intimitat de les persones. És també una glosa a la relació que Ferrer mantenia aleshores amb Soledat Villafranca. L'última part té més contingut ideològic relacionat amb l'ideari pedagògic ferrerià.

Altra documentació:

• 800 llibres i 300 documents, antics i actuals, del període 1880-1936.
• 400 articles i documents sobre Ferrer i l'Escola Moderna extrets de diaris i revistes i dels arxius de la Universitat Lliure de Brussel·les i de la ciutat de Brussel·les.
• 450 fitxes del buidat del Diari de Barcelona (1 d'octubre a 23 d'octubre de 1909) referents al cas Ferrer: judici, sentència, afusellament, repercussions nacionals i internacionals, etc.
• 260 fotografies i diapositives donades pel Centre National et Musée Jean Jaurès de Castres (França), a partir de l'exposició "El cas Ferrer" que va organitzar aquest Centre amb motiu del 80 aniversari de la mort de Ferrer i Guàrdia.
• 90 fotografies obtingudes per la Fundació, a partir de la compra de revistes i documents de l'època.
• La col·lecció completa (fotocopiada) donada pel Sr. Brignoli (Itàlia) dels butlletins de l'Escola Moderna.